Desde sus inicios la fiesta principal de la Cofradía tuvo lugar el día 3 de Mayo en razón a que el título fundacional de la Cofradía fue el de “Cofradía de la Cruz de Santa Elena”.

En 1751, por devoción de Dª María Leonarda de Lamas Mendoza y Torres, que lo dotó generosamente con sus bienes, se instituyó un Septenario en honor de la Virgen de los Dolores.

A partir de 1823 se hizo muy popular la celebración de una novena en honor de Jesús Nazareno, que en algunas épocas tuvo carácter multitudinario. En principio se celebraba de forma discontinua, en los domingos y días festivos de la Cuaresma finalizando el Domingo de Ramos. Desde 1952 se celebra de manera continuada acabando el Domingo de Pasión.

Otros cultos notables han sido los “Terceros Domingos a N. P. Jesús”, diversos tipos de ejercicios y encuentros cuaresmales y numerosos cultos particulares a intención de cofrades y devotos.

Desde 1980 tiene gran trascendencia ciudadana el besapié que se celebra en Cuaresma.